Les recherches de Robotnik étaient financées par la Fédération des États-Unis (la Sonique (l’équivalent des États-Unis). Il a été initialement conçu comme un moyen de créer une arme vivante, bien que la motivation personnelle de Robotnik ait été de sauver Maria. Au cours de ses recherches, Robotnik a créé deux êtres immortels : Shadow et un prototype reptilien géant appelé le Biolizard. Contrairement à Shadow, le Biolizard était violent et incontrôlable, un Une fois que la Fédération Unie en a eu vent, la décision a été prise de fermer le projet et d’éliminer tous ceux qui en avaient connaissance. Une escouade de soldats du GUN (Guardian Unit of Nations) a été déployée sur la station, arrêtant Robotnik, tuant des chercheurs et évacuant des civils. Cependant, un civil a été pris entre deux feux : Maria.
Différentes versions de l’histoire de Shadow à travers les jeux et l’univers étendu décrivent la mort de Maria différemment. Le jeu de 2005 Shadow le hérisson montre un soldat qui lui abat de sang froid pendant que le Sonic X L’anime le montre en train de la tuer lorsqu’elle refuse de se conformer à ses ordres. Que faisait-elle pour qu’ils trouvent cela si répréhensible ? Elle envoyait Shadow sur Terre afin de le sauver du massacre.
Dans son dernier souffle, elle demande à Shadow d’apporter de l’espoir à l’humanité alors qu’il est envoyé sur Terre dans une capsule de sauvetage. On pourrait penser que ce souhait aurait conduit Shadow à sauver le monde plutôt qu’à tenter de le détruire. Alors, que s’est-il passé ?
Comme cela est révélé tout au long Sonic Adventure 2, Robotnik est devenu fou après la perte de Maria et de ses recherches. Même pendant qu’il était emprisonné par GUN et poursuivant son travail sous une surveillance plus étroite, le docteur a commencé à planifier sa vengeance. S’il ne parvenait pas à sauver Maria, il détruirait les humains qui lui avaient tout pris. Cela incluait de faire un lavage de cerveau à Shadow pour faire oublier le dernier souhait de Maria, en faisant en lui le souvenir comme s’il lui demandait de se venger.
Shadow fut finalement capturé par GUN et mis en stase, où il resta pendant 50 ans. Finalement réveillé par Eggman toutes ces années plus tard, il manipula le docteur pour qu’il apporte les sept émeraudes du chaos aux vestiges de la colonie spatiale Ark, affirmant qu’il voulait d’utiliser l’énergie des pierres pour alimenter le puissant canon à éclipse de la station et menacer les habitants de la Terre jusqu’à ce qu’ils se soumettent. Mais en vérité, son plan était d’utiliser les émeraudes pour mettre la station sur une trajectoire de collision avec la planète, la détruisant ainsi que toute l’humanité.
Shadow a presque réussi, lui aussi, avant que la fausse petite-amie de Sonic, Amy Rose, ne lui rappelle le véritable souhait de Maria avant sa mort. Il a ensuite rejoint le reste de nos héros pour arrêter la descente de l’Arche en utilisant les Émeraudes du Chaos pour vaincre le Biolizard qui avait été libéré de son emprisonnement dans les profondeurs de la station. Puis, après avoir utilisé tout son pouvoir pour stabiliser l’Arche, il est tombé sur Terre. Le reste de nos héros l’ont pleuré, mais ont célébré le fait qu’il ait pu réaliser le souhait de Maria.